Документооборот велся частично в электронном, частично в бумажном виде. Институт получал входящую документацию, отправлял исходящую по большей части на бумажных носителях. Некоторые документы отправлялись на согласование в электронной системе «Тезис», но при этом подписи согласующих лиц собирались ответственными за исполнение очно. То есть в дополнение к электронному согласованию визы проставлялись лично на распечатанном документе. Следует отметить, что поскольку Институт имеет несколько географически разобщенных площадок, приходилось регулярно прибегать к услугам курьера для доставки документа для согласования ответственным лицом. При этом в Институте отсутствовал утвержденный регламент по работе с договорными документами, что также тормозило процесс согласования, утверждения документов и контроль их исполнения.